Védett területek
A felügyelőség illetékességi területén az alábbi 27 országos jelentőségű, védett természeti terület fekszik (felsorolás a védetté nyilvánítás sorrendjében):

A babati 4-es tó a Gödöllői-Dombvidék Tájvédelmi
Körzet területén
Csévharaszti borókás (105 ha), a Szentendrei rózsa termőhelye (1 ha), Ipolytarnóci ősmaradványok (513 ha), Pál-völgyi-barlang felszíne (1 ha), Vácrátóti Arborétum (28 ha), Fóti Somlyó (282 ha), Szemlőhegyi- barlang felszíne (1 ha), Budai Sas-hegy (30 ha), Budapesti Botanikus-kert (3 ha), Dabasi turjános (148 ha), Ócsai Tájvédelmi Körzet (3576 ha), Jókai kert (3 ha), Hollókői Tájvédelmi Körzet (141 ha), Budai Tájvédelmi Körzet (10528 ha), Magyarország földrajzi középpontja (5 ha), Turai legelő (14 ha), Kelet-Cserháti Tájvédelmi Körzet (6915 ha), Karancs-Medvesi Tájvédelmi Körzet (6709), Gödöllői-Dombvidék Tájvédelmi Körzet (11817 ha), Háros-szigeti Ártéri Erdők (56 ha), Peregi parkerdő (12 ha), Rácalmási szigetek (382 ha), Gellérthegy (40 ha), Duna-Ipoly Nemzeti Park illetékességi területére eső részei (51107 ha), Gödöllői Királyi Kastélypark (26 ha), Tápió-Hajta vidéke Tájvédelmi Körzet (e körzetbe eső része 4394 ha), ami összesen kereken 96800 hektárt tesz ki.
E listát egészítik ki az 1961 óta ex lege védelem alatt álló barlangok, és az 1996-ban alkotott természetvédelmi törvény által (ex lege) védelem alá helyezett szikes tavak, lápok, források, víznyelők, földvárak és kunhalmok.

Molyhos tölgy a fokozottan védett fóti Somlyón
A fentieken felül Budapesten 43, Pest megyében 90, Nógrád megyében 80, Heves megyében 7, vagyis összesen 220 helyi jelentőségű természeti terület áll természetvédelmi oltalom alatt közel 7000 ha kiterjedésben.
Az országos és helyi jelentőségű védett természeti területek által elfoglalt terület így kereken 104.000 hektár, ami a felügyelőség illetékességi területének több mint 12%-a, vagyis meghaladja az országos átlagot.
